Ruim 3,8 miljoen kiezers konden op 9 november hun stem uitbrengen in 146 gemeenten voor de verkiezingen van burgemeesters en gemeenteraden. Het werd een gedenkwaardige gebeurtenis door de chaos, het geweld en de waarschijnlijke fraude.
De voorlopige uitslagen, zoals bekend gemaakt door de Hoge Kiesraad CSE), werden aangevochten door de PLC, de werkgeversorganisaties Cosep en Amcham, de katholieke bisschoppen, de onafhankelijke organisaties Ipade en Etica y Transparencia (E y T). De laatste twee mochten geen waarnemer zijn hoewel ze een respectabele naam hebben door hun optreden tijdens vorige verkiezingen. Zowel president Ortega als de CSE verklaarden dat er geen nationale noch internationale onafhankelijke pottenkijkers nodig waren.
Volgens de voorlopige uitslagen van de CSE op maandagmiddag zou de FSLN in 94 gemeenten gewonnen hebben, een grotere overwinning dan in 2004 toen ze 87 gemeenten in de wacht sleepte. De PLC zou de meerderheid hebben gehaald in 46 gemeenten (57 in 2004). In de vroege morgen van woensdag 12 november waren de uitslagen nog niet definitief. Ook over de opkomst is nog niks bekend.
E y T, die met zijn 30 duizend waarnmers op eigen houtje controles uitvoerde buiten de stemlokalen, meldde dat in zeker 32 procent van de stemlokalen onregelmatigheden zijn voorgekomen. In veel gevallen konden controleurs (fiscales) van de liberalen hun werk niet doen, een ernstig feit omdat de CSE en Ortega juist die controle zo ophemelden. "Dit waren de minst transparante verkiezingen van de afgelopen jaren", zei voorzitster Alta Hooker van E. y T.
Op maandag 10 november vonden er op vele plaatsen in het land gevechten plaats tussen aanhangers van PLC en FSLN. De CSE stelde de media en Montealegre, kandidaat voor de PLC in Managua, verantwoordelijk voor het geweld in de hoofdstad. De vele tv-beelden op verschillende nationale zenders toonden aan dat het een partijdige conclusie is van een staatsorgaan waarvan neutraliteit verwacht zou mogen worden.